Alguns anos depois dos eventos que quase devastaram o planeta de Avalice, quatro guerreiras poderosas precisam lidar com uma nova ameaça, um inimigo ancestral que emerge das profundezas da terra cheia de ódio e sede de vingança. Freedom Planet 2, um jogo single player de plataforma 2D com estética pixel art, nos coloca na pele de uma dessas heroínas em níveis claramente inspirados na franquia Sonic The Hedgehog, com sistemas complexos de combate e exploração, mostrando que somente juntas elas poderão salvar o mundo de novo.