Fatal Frame: Maiden of Black Water narra a história da montanha Hikami, um lugar onde as pessoas, curiosamente, encontraram um lugar para cometer suicídio “em paz”. Porém, há algo de errado com o local, e Yuri, uma das meninas que tentou se matar, vai atrás de respostas.

Neste jogo você assume o papel de três personagens distintos, com diferentes perspectivas da história, mas que se conectam umas com as outras. No papel de Yuri, Ren e Miu, é preciso usar sua Câmera Obscura para descobrir o que de fato assombra a montanha Hikami e acabar com a maldição do lugar.